102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01610 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE01610  expressed protein  100 
 
 		 243 aa  495  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19114  predicted protein  28.14 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0738434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_22565  predicted protein  27.37 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0043227  normal  0.0742578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  25.26 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1529  cyclase/dehydrase  23.24 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  26.18 
 
 		 161 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10642  sreptomyces cyclase/dehydrase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07220)  27.89 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000348304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  23.91 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  25.13 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  24.86 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1580  putative polyketide cyclase / dehydrase  22.58 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0427805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  25.13 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  23.04 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3005  cyclase/dehydrase  22.51 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  31 
 
 		 151 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2750  cyclase/dehydrase  30.77 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  28.83 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 153 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 164 aa  53.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  24.58 
 
 		 182 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  22.46 
 
 		 148 aa  52.8  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  27.35 
 
 		 151 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  21.28 
 
 		 144 aa  52  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1617  hypothetical protein  23.04 
 
 		 153 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.441973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  24.58 
 
 		 144 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  24.58 
 
 		 144 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  23.89 
 
 		 149 aa  52  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  21.28 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  24.58 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  23.78 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  24.32 
 
 		 144 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  25.74 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  23.66 
 
 		 150 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  23.91 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  23.91 
 
 		 145 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  23.91 
 
 		 145 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  24.32 
 
 		 144 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  23.24 
 
 		 144 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  23.37 
 
 		 149 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3970  cyclase/dehydrase  23.5 
 
 		 143 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.578911 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  23.56 
 
 		 144 aa  49.3  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2053  cyclase/dehydrase  22.7 
 
 		 146 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  25.67 
 
 		 158 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  24.46 
 
 		 158 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  24.46 
 
 		 158 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 		 158 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  23.91 
 
 		 158 aa  48.9  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  24.46 
 
 		 158 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  23.91 
 
 		 158 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  24.46 
 
 		 158 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  24.06 
 
 		 158 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  24.06 
 
 		 158 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  24.06 
 
 		 158 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  24.06 
 
 		 158 aa  48.5  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  23.24 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0445  cyclase/dehydrase  24.6 
 
 		 145 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  24.55 
 
 		 153 aa  48.5  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1392  oligoketide cyclase/lipid transport protein  24.06 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000575207  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1454  polyketide cyclase/dehydrase family protein  24.06 
 
 		 146 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000012561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  28.32 
 
 		 152 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  28.32 
 
 		 152 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  24.75 
 
 		 136 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  22.83 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  22.83 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0456  cyclase/dehydrase  20.54 
 
 		 161 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501936 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0280  hypothetical protein  20.54 
 
 		 161 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  21.08 
 
 		 159 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  22.83 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  22.83 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 152 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  23.32 
 
 		 146 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  24.08 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  20.97 
 
 		 147 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  21.08 
 
 		 146 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0524  cyclase/dehydrase  20 
 
 		 152 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  21.08 
 
 		 146 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  23.24 
 
 		 145 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6534  cyclase/dehydrase  27.52 
 
 		 151 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00656463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2887  cyclase/dehydrase  26.13 
 
 		 157 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  22.83 
 
 		 148 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  24.04 
 
 		 150 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  23.89 
 
 		 152 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5925  cyclase/dehydrase  29.25 
 
 		 151 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.910171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  23.91 
 
 		 148 aa  45.4  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  22.16 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2004  cyclase/dehydrase  20.53 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0398865  normal  0.691542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  22.28 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  23.08 
 
 		 150 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  21.08 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1696  hypothetical protein  20.77 
 
 		 164 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  21.81 
 
 		 175 aa  43.5  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2058  cyclase/dehydrase  27.68 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00806179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  21.74 
 
 		 150 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  21.74 
 
 		 150 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  21.08 
 
 		 143 aa  42.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  23.56 
 
 		 155 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2585  cyclase/dehydrase  24.55 
 
 		 157 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  hitchhiker  0.00428625 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3228  cyclase/dehydrase  23.68 
 
 		 154 aa  42.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  20.65 
 
 		 145 aa  42  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>