173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2058 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2058  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 155 aa  319  8e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00806179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1617  hypothetical protein  70.32 
 
 		 153 aa  221  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.441973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  52.94 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  52.94 
 
 		 146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  52.94 
 
 		 146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  52.29 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2004  cyclase/dehydrase  52.6 
 
 		 148 aa  166  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0398865  normal  0.691542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  50.98 
 
 		 147 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3005  cyclase/dehydrase  50.32 
 
 		 168 aa  159  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3902  cyclase/dehydrase  49.67 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2437  cyclase/dehydrase  49.02 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6079  cyclase/dehydrase  43.51 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1998  cyclase/dehydrase  43.51 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2031  cyclase/dehydrase  42.86 
 
 		 145 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1860  cyclase/dehydrase  45.75 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1278  cyclase/dehydrase  42.21 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.775786  normal  0.639124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  42.86 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1425  hypothetical protein  42.21 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0213458  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1755  hypothetical protein  44.44 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2050  cyclase/dehydrase superfamily  41.56 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0938384  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  41.56 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  41.56 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  41.56 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  42.86 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  41.56 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  41.56 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  41.56 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  41.06 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1703  hypothetical protein  40.26 
 
 		 145 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  40.4 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1202  cyclase/dehydrase  42.21 
 
 		 145 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1457  cyclase/dehydrase  43.23 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  41.56 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  38.96 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2626  cyclase/dehydrase  41.45 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  41.33 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  40.52 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  38.41 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2018  cyclase/dehydrase  44.2 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  39.74 
 
 		 144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0964  cyclase/dehydrase  42.58 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1900  cyclase/dehydrase  43.48 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1603  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1144  cyclase/dehydrase  43.42 
 
 		 145 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.322411 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0527  cyclase/dehydrase  40.52 
 
 		 143 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1197  cyclase/dehydrase  37.42 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2341  cyclase/dehydrase  43.79 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  38.67 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  37.75 
 
 		 144 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  37.75 
 
 		 182 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  36.18 
 
 		 147 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1425  cyclase/dehydrase  39.87 
 
 		 143 aa  126  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  38.41 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  39.07 
 
 		 144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  36.18 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0435  hypothetical protein  38.31 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0411  hypothetical protein  38.31 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3828  aromatic rich family protein  37.91 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  39.61 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  38.06 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  38.06 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  38.06 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  37.91 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  38.06 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  38.16 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1317  cyclase/dehydrase  40.58 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0865024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  38.82 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  37.33 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  38.06 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  38.06 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  38.06 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  38.06 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1335  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 145 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3051  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 145 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.247309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1308  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 145 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1299  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 145 aa  120  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  38.16 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  38.16 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  38.16 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  38.82 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  38.16 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  38.06 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  38.06 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  37.42 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  36.84 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  36.84 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  36.84 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  38.06 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  36.84 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  37.25 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3368  cyclase/dehydrase  38 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00867336  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1521  cyclase/dehydrase  34.19 
 
 		 145 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351498  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1740  cyclase/dehydrase  38.16 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2739  hypothetical protein  37.75 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000766301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  34.21 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>