128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_22565 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_22565  predicted protein  100 
 
 		 165 aa  343  6e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0043227  normal  0.0742578 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10642  sreptomyces cyclase/dehydrase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07220)  36 
 
 		 239 aa  89.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000348304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01610  expressed protein  27.37 
 
 		 243 aa  70.9  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19114  predicted protein  26.92 
 
 		 237 aa  67  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0738434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1623  cyclase/dehydrase  26 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1876  cyclase/dehydrase  22.3 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458144  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3373  cyclase/dehydrase  28.08 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3902  cyclase/dehydrase  23.97 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2750  cyclase/dehydrase  22.15 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258505  normal  0.0234305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2758  cyclase/dehydrase  27.86 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2066  cyclase/dehydrase  28.78 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2291  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1280  cyclase/dehydrase  22.78 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  25.68 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  24.31 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0539  cyclase/dehydrase family protein  23.53 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0189315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  24.31 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2004  cyclase/dehydrase  28 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0398865  normal  0.691542 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1081  hypothetical protein  26.28 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.710996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3005  cyclase/dehydrase  26.49 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126303  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1123  hypothetical protein  26.28 
 
 		 136 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447195  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  26.12 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1367  cyclase/dehydrase  20 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  22.92 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2175  cyclase/dehydrase  24.16 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.51911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  22.92 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2858  cyclase/dehydrase  25.16 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281065  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  25.97 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  22.92 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  20.67 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0445  cyclase/dehydrase  24.09 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0136661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  20.67 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  21.48 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6534  cyclase/dehydrase  24.03 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00656463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1617  hypothetical protein  25.35 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.441973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  21.53 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1807  cyclase/dehydrase  25.55 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529601  hitchhiker  0.000967244 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0524  cyclase/dehydrase  23.91 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  27.4 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  25.69 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1614  cyclase/dehydrase  25.55 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  25.69 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  25.69 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  22.92 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2434  cyclase/dehydrase  21.99 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.37725  normal  0.141169 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  25.93 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2231  cyclase/dehydrase  21.62 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3870  cyclase/dehydrase  20 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2825  cyclase/dehydrase  26.03 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1085  cyclase/dehydrase  25.56 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  23.61 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1283  cyclase/dehydrase  23.88 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106424  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2058  cyclase/dehydrase  25.83 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00806179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  23.61 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  24.31 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  24.63 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63050  hypothetical protein  23.29 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  24.31 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3630  cyclase/dehydrase  22.92 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0242  cyclase/dehydrase  20.41 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495408  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1392  oligoketide cyclase/lipid transport protein  23.24 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000575207  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1454  polyketide cyclase/dehydrase family protein  23.24 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000012561  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  24.31 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  24.31 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0166  cyclase/dehydrase  24.34 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.900477  hitchhiker  0.00454879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  24.31 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5487  hypothetical protein  23.29 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  22.92 
 
 		 145 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  23.88 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2478  hypothetical protein  25.34 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0202034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  23.88 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  23.88 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  23.88 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  23.88 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1521  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351498  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  24.31 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1531  hypothetical protein  21.99 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2031  hypothetical protein  21.99 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3281  hypothetical protein  21.99 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.238258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2411  hypothetical protein  21.99 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.887762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2465  hypothetical protein  21.99 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1302  hypothetical protein  21.99 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2924  cyclase/dehydrase  22.52 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3051  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.247309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1308  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1299  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3028  cyclase/dehydrase  22.52 
 
 		 152 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal  0.379751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1335  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2800  cyclase/dehydrase  22.52 
 
 		 152 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  19.73 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  20.53 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1922  cyclase/dehydrase  21.64 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.09657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>