118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03700 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04789  DNA polymerase (EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X142]  48 
 
 		 1681 aa  920    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03700  zeta DNA polymerase, putative  100 
 
 		 1940 aa  4035    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.634072  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42338  DNA polymerase zeta  37.85 
 
 		 1489 aa  677    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  29.73 
 
 		 1070 aa  302  4e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  29.2 
 
 		 1044 aa  259  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  27.83 
 
 		 1058 aa  259  4e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  27.77 
 
 		 1087 aa  255  5.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  27.51 
 
 		 982 aa  241  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  26.21 
 
 		 941 aa  181  9e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  25.15 
 
 		 910 aa  176  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  24.59 
 
 		 932 aa  157  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  24.3 
 
 		 784 aa  131  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  24.12 
 
 		 781 aa  119  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  24.27 
 
 		 990 aa  115  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  24.21 
 
 		 1459 aa  110  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  23.51 
 
 		 786 aa  110  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  23.21 
 
 		 785 aa  107  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  23.4 
 
 		 794 aa  104  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  22.39 
 
 		 780 aa  104  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  24.59 
 
 		 812 aa  102  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  24.21 
 
 		 1485 aa  100  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  22.6 
 
 		 810 aa  100  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  22.75 
 
 		 796 aa  98.6  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  22.51 
 
 		 811 aa  98.6  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  22.8 
 
 		 780 aa  96.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  21.46 
 
 		 781 aa  96.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  22.95 
 
 		 821 aa  96.3  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  23.33 
 
 		 784 aa  95.9  7e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  22.76 
 
 		 783 aa  95.5  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  24.04 
 
 		 912 aa  91.3  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  23.74 
 
 		 789 aa  90.5  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  23.16 
 
 		 795 aa  88.2  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  24.13 
 
 		 783 aa  87.4  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  24.66 
 
 		 816 aa  85.5  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  24 
 
 		 1463 aa  84  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  22.52 
 
 		 929 aa  81.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  23.91 
 
 		 787 aa  80.5  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  23.79 
 
 		 818 aa  78.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  23.12 
 
 		 794 aa  78.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  22.87 
 
 		 787 aa  75.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  26.68 
 
 		 816 aa  73.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  23.73 
 
 		 786 aa  73.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  23.52 
 
 		 1353 aa  73.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  23.09 
 
 		 799 aa  72.8  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  23.77 
 
 		 793 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  25.78 
 
 		 791 aa  70.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  24.58 
 
 		 809 aa  69.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  22.9 
 
 		 818 aa  69.3  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  25.96 
 
 		 820 aa  68.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  22.49 
 
 		 786 aa  68.6  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  24.47 
 
 		 809 aa  67.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  22.46 
 
 		 795 aa  67.4  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  24.7 
 
 		 809 aa  67  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  26.1 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  26.1 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  26.1 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  26.1 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  26.1 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  26.1 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  26.1 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  26.1 
 
 		 783 aa  66.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  25.41 
 
 		 808 aa  65.9  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  22.11 
 
 		 788 aa  65.9  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  24.47 
 
 		 809 aa  65.9  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  22.81 
 
 		 788 aa  65.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  24.6 
 
 		 788 aa  65.9  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  22.15 
 
 		 792 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  22.71 
 
 		 821 aa  64.7  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  23.3 
 
 		 794 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  23.3 
 
 		 794 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  22.22 
 
 		 789 aa  63.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  29.19 
 
 		 877 aa  63.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  24.67 
 
 		 810 aa  63.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  22.41 
 
 		 789 aa  63.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  23.98 
 
 		 793 aa  63.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  22.6 
 
 		 792 aa  62.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  22.73 
 
 		 794 aa  62.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  22.43 
 
 		 782 aa  62.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  25.61 
 
 		 783 aa  62.8  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  23.9 
 
 		 810 aa  62.4  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  22.26 
 
 		 789 aa  62.4  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  22.26 
 
 		 789 aa  62.4  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  22.26 
 
 		 791 aa  62  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  23.77 
 
 		 788 aa  62  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  25.24 
 
 		 787 aa  61.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  25.14 
 
 		 835 aa  61.6  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  21.03 
 
 		 801 aa  61.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  27.27 
 
 		 786 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  24.85 
 
 		 783 aa  60.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  21.65 
 
 		 790 aa  60.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  24.7 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  24.7 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  24.7 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  26.03 
 
 		 786 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  22.37 
 
 		 809 aa  58.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  26.03 
 
 		 786 aa  58.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  25.24 
 
 		 788 aa  58.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  22.77 
 
 		 787 aa  58.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  23.67 
 
 		 788 aa  57.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  23.1 
 
 		 787 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>