127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42338 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_04789  DNA polymerase (EC 2.7.7.7) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X142]  42.13 
 
 		 1681 aa  810    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03700  zeta DNA polymerase, putative  37.85 
 
 		 1940 aa  686    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.634072  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42338  DNA polymerase zeta  100 
 
 		 1489 aa  3063    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  27.19 
 
 		 1070 aa  265  6e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  27.24 
 
 		 982 aa  258  6e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  28.63 
 
 		 1087 aa  256  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  25.71 
 
 		 1058 aa  251  8e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  27.64 
 
 		 1044 aa  236  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  25.82 
 
 		 910 aa  203  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  24.61 
 
 		 941 aa  182  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  25.62 
 
 		 932 aa  179  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  24.96 
 
 		 784 aa  150  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  23.61 
 
 		 794 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  22.02 
 
 		 1459 aa  124  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  24.32 
 
 		 783 aa  120  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  23.75 
 
 		 783 aa  120  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  23.91 
 
 		 780 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  22.66 
 
 		 1463 aa  119  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  23.79 
 
 		 786 aa  118  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  23.74 
 
 		 784 aa  115  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  23.03 
 
 		 785 aa  114  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  21.23 
 
 		 990 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  23.8 
 
 		 781 aa  113  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  23.89 
 
 		 780 aa  108  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  21.77 
 
 		 781 aa  108  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  24.62 
 
 		 810 aa  106  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  24.41 
 
 		 816 aa  105  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  22.69 
 
 		 1485 aa  105  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  23.81 
 
 		 812 aa  104  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  22.49 
 
 		 787 aa  101  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  24.09 
 
 		 783 aa  99  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  24.18 
 
 		 783 aa  98.6  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  24.18 
 
 		 783 aa  98.6  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  24.09 
 
 		 783 aa  98.6  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  24.09 
 
 		 783 aa  98.6  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  24.09 
 
 		 783 aa  98.2  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  22.66 
 
 		 796 aa  97.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  23.83 
 
 		 821 aa  97.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  24.18 
 
 		 783 aa  97.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  22.28 
 
 		 929 aa  96.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  26.79 
 
 		 783 aa  96.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  23.85 
 
 		 794 aa  95.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  22.19 
 
 		 786 aa  95.9  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0607  DNA polymerase II  24.19 
 
 		 820 aa  95.9  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427603  normal  0.519282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2273  DNA polymerase II  24.15 
 
 		 818 aa  95.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  24.03 
 
 		 783 aa  94.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  23.03 
 
 		 790 aa  93.2  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  22.02 
 
 		 793 aa  92.8  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  22.33 
 
 		 795 aa  92.8  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  22.18 
 
 		 912 aa  92.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  24.26 
 
 		 789 aa  91.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  24.1 
 
 		 789 aa  91.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  22.1 
 
 		 792 aa  91.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  23.21 
 
 		 783 aa  90.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  23.21 
 
 		 783 aa  89.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  23.36 
 
 		 783 aa  89.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  23.21 
 
 		 783 aa  89  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  25.57 
 
 		 789 aa  88.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  22.14 
 
 		 792 aa  88.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  22.73 
 
 		 788 aa  88.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  22.34 
 
 		 786 aa  88.6  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  25.57 
 
 		 789 aa  87.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  22.6 
 
 		 791 aa  88.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  25.57 
 
 		 789 aa  87.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  21.95 
 
 		 799 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  23.44 
 
 		 787 aa  86.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  22.07 
 
 		 787 aa  85.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  23.64 
 
 		 818 aa  85.5  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  23.38 
 
 		 821 aa  85.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  23.09 
 
 		 787 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  23.84 
 
 		 788 aa  84  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  23.82 
 
 		 1353 aa  84  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  22.66 
 
 		 787 aa  84  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  20.81 
 
 		 801 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  21.03 
 
 		 816 aa  82.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  22.32 
 
 		 809 aa  81.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  24.37 
 
 		 811 aa  81.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  22 
 
 		 788 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  21.75 
 
 		 786 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  23.35 
 
 		 788 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  21.26 
 
 		 791 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  22.21 
 
 		 807 aa  80.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  21.58 
 
 		 793 aa  80.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  23.16 
 
 		 787 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  22.74 
 
 		 809 aa  79.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  22.46 
 
 		 790 aa  79.3  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  21.6 
 
 		 786 aa  79.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  21.99 
 
 		 788 aa  79.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  21.47 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  0.0000408112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  22.62 
 
 		 809 aa  79  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  22.21 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  21.15 
 
 		 794 aa  78.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  21.35 
 
 		 810 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  24.28 
 
 		 788 aa  78.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  21.15 
 
 		 794 aa  77  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  21.31 
 
 		 810 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  21.15 
 
 		 794 aa  77  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  21.32 
 
 		 786 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  22.32 
 
 		 786 aa  77.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2007  DNA-directed DNA polymerase B  23.27 
 
 		 788 aa  76.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>