More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1248 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0970  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  65.52 
 
 
527 aa  711    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1569  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  71.81 
 
 
525 aa  791    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0922  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  65.13 
 
 
527 aa  709    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0615  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  68 
 
 
528 aa  743    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0119419  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1188  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  67.18 
 
 
526 aa  715    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0480  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  67.24 
 
 
525 aa  749    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1248  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
525 aa  1072    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  65.33 
 
 
527 aa  711    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0512  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  73.14 
 
 
525 aa  815    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0875  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  58.48 
 
 
529 aa  601  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0119441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0009  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.46 
 
 
530 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0352108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.15 
 
 
526 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0786  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.96 
 
 
527 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.56 
 
 
534 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.92 
 
 
532 aa  368  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0259  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.91 
 
 
529 aa  364  3e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.51 
 
 
527 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.69 
 
 
531 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.19 
 
 
528 aa  348  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.48 
 
 
527 aa  347  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.7 
 
 
529 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.62 
 
 
529 aa  346  6e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4106  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.78 
 
 
529 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885327  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.65 
 
 
529 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.13 
 
 
529 aa  344  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.83 
 
 
529 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.15 
 
 
529 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.8 
 
 
529 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.1 
 
 
532 aa  343  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1423  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.24 
 
 
527 aa  342  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.37 
 
 
531 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.4 
 
 
525 aa  341  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.47 
 
 
529 aa  341  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0174  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.79 
 
 
529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996447  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1119  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.83 
 
 
529 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0614  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.96 
 
 
528 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.84 
 
 
531 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.25 
 
 
529 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.18 
 
 
531 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.15 
 
 
526 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.31 
 
 
527 aa  336  5e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.72 
 
 
531 aa  336  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.67 
 
 
525 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.43 
 
 
523 aa  334  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1352  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.43 
 
 
534 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.43 
 
 
531 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3318  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.18 
 
 
531 aa  333  4e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.81 
 
 
524 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.16 
 
 
531 aa  333  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08560  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.84 
 
 
531 aa  332  8e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.461142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.09 
 
 
526 aa  332  9e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.68 
 
 
531 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.17 
 
 
529 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119542  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1202  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.98 
 
 
528 aa  330  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661102  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.28 
 
 
527 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3521  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.54 
 
 
529 aa  330  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3546  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.91 
 
 
531 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2650  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.5 
 
 
528 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.02 
 
 
531 aa  329  9e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570425  hitchhiker  0.00544887 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1543  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.24 
 
 
527 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00623773  hitchhiker  0.0000362163 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3021  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.37 
 
 
531 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.29 
 
 
525 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.29 
 
 
525 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.72 
 
 
528 aa  326  8.000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3100  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.92 
 
 
525 aa  326  8.000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.659114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.55 
 
 
525 aa  325  8.000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.38 
 
 
523 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.917938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8047  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.92 
 
 
529 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328727  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.35 
 
 
523 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3115  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.03 
 
 
535 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00187643  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1760  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.52 
 
 
531 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.95 
 
 
523 aa  320  3e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2680  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.74 
 
 
540 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.35 
 
 
523 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.28 
 
 
533 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447631  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0527  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.83 
 
 
528 aa  320  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.209223  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1629  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.28 
 
 
533 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1229  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.88 
 
 
533 aa  320  5e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.17 
 
 
536 aa  319  7e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2150  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.27 
 
 
528 aa  319  7.999999999999999e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204731  normal  0.434509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2138  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.63 
 
 
525 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1236  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.6 
 
 
531 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.41 
 
 
529 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.36 
 
 
523 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.88 
 
 
531 aa  317  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2276  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.45 
 
 
529 aa  316  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000102369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4467  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.31 
 
 
526 aa  316  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0468875  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0672  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.4 
 
 
535 aa  316  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0431754 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.81 
 
 
523 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1126  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.59 
 
 
531 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4312  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.56 
 
 
533 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3860  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.55 
 
 
539 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000678395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0660  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.4 
 
 
535 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2536  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.26 
 
 
529 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0175573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.29 
 
 
652 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.63 
 
 
532 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.04 
 
 
527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0926  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.21 
 
 
528 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05241  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.54 
 
 
528 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2827  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  33.21 
 
 
546 aa  313  5.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>