More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1569 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0512  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  87.05 
 
 
525 aa  944    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0970  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  68.76 
 
 
527 aa  733    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0480  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  67.43 
 
 
525 aa  739    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1569  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
525 aa  1071    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0875  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  61.38 
 
 
529 aa  641    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0119441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0615  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  70.48 
 
 
528 aa  763    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0119419  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0922  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  68.19 
 
 
527 aa  730    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1188  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  65.78 
 
 
526 aa  701    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1248  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  71.81 
 
 
525 aa  773    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  68.57 
 
 
527 aa  734    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0786  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.53 
 
 
527 aa  383  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.37 
 
 
534 aa  381  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0259  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40 
 
 
529 aa  380  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.15 
 
 
526 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.04 
 
 
527 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.15 
 
 
532 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0009  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.12 
 
 
530 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0352108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.49 
 
 
527 aa  371  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.26 
 
 
529 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.23 
 
 
531 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.56 
 
 
528 aa  363  4e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.61 
 
 
529 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.79 
 
 
527 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.25 
 
 
527 aa  350  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.62 
 
 
531 aa  350  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.98 
 
 
523 aa  349  5e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.99 
 
 
525 aa  349  7e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.45 
 
 
529 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4106  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.28 
 
 
529 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885327  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.29 
 
 
529 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.26 
 
 
531 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.19 
 
 
529 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.22 
 
 
526 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1543  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.76 
 
 
527 aa  345  1e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00623773  hitchhiker  0.0000362163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.62 
 
 
528 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966677  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.74 
 
 
529 aa  342  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.61 
 
 
524 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.95 
 
 
525 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.12 
 
 
531 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3115  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.06 
 
 
535 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00187643  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0614  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.52 
 
 
528 aa  340  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.67 
 
 
525 aa  340  5e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.61 
 
 
529 aa  339  5.9999999999999996e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3521  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.49 
 
 
529 aa  339  7e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598848  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.63 
 
 
526 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0174  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.43 
 
 
529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996447  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.78 
 
 
532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2650  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.02 
 
 
528 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.92 
 
 
531 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.16 
 
 
531 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.48 
 
 
529 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1352  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.16 
 
 
534 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.85 
 
 
529 aa  336  5.999999999999999e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1737  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.38 
 
 
541 aa  336  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1423  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.47 
 
 
527 aa  336  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.16 
 
 
531 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8047  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.31 
 
 
529 aa  336  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328727  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1119  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.25 
 
 
529 aa  335  9e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.76 
 
 
525 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.76 
 
 
525 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.1 
 
 
528 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.28 
 
 
529 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.33 
 
 
529 aa  333  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119542  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1018  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.02 
 
 
527 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000612711 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0896  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.02 
 
 
527 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643854  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.16 
 
 
531 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570425  hitchhiker  0.00544887 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1198  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.19 
 
 
542 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0190635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.02 
 
 
526 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.22 
 
 
528 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15151  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.31 
 
 
528 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.14 
 
 
528 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.52 
 
 
533 aa  330  3e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447631  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1629  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.52 
 
 
533 aa  330  3e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3546  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.96 
 
 
531 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3860  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.03 
 
 
539 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000678395  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.49 
 
 
523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2087  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.72 
 
 
535 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0521319  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2680  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.3 
 
 
540 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1229  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.45 
 
 
533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270378  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.05 
 
 
523 aa  327  3e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.917938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.35 
 
 
532 aa  326  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2827  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.59 
 
 
546 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.2 
 
 
652 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2378  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.33 
 
 
541 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0367603  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.87 
 
 
531 aa  324  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.8 
 
 
528 aa  324  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.1 
 
 
523 aa  323  4e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1961  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.16 
 
 
532 aa  322  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0710  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.43 
 
 
542 aa  322  8e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.196237  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.72 
 
 
546 aa  322  9.000000000000001e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.19 
 
 
523 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4312  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.18 
 
 
533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2813  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.85 
 
 
532 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2276  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.98 
 
 
529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000102369 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08560  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.5 
 
 
531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.461142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.91 
 
 
523 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1760  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.14 
 
 
531 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.08 
 
 
531 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.88 
 
 
536 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_539  phosphoglycerate dehydrogenase  36.73 
 
 
526 aa  320  6e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.366241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>