More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11758 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11758  putative copper/silver resistance-related transport membrane protein  100 
 
 		 1250 aa  2519    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2310  acriflavin resistance protein  50.82 
 
 		 1287 aa  1290    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.819733  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11383  putative copper/silver resistance-related transport membrane protein  75.52 
 
 		 1258 aa  1887    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4432  CzcA family heavy metal efflux protein  34.12 
 
 		 1108 aa  629  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4015  CzcA family heavy metal efflux protein  32.4 
 
 		 1050 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.310699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3565  acriflavin resistance protein  59.22 
 
 		 1208 aa  599  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5194  normal  0.110212 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0278  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.35 
 
 		 1090 aa  560  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3989  CzcA family heavy metal efflux protein  32.19 
 
 		 1045 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2164  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.49 
 
 		 1045 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  46.05 
 
 		 1045 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3079  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.3 
 
 		 1045 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.931576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2058  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.3 
 
 		 1045 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000624585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  44.74 
 
 		 1048 aa  458  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  45.11 
 
 		 1045 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  28.3 
 
 		 1043 aa  445  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  44.55 
 
 		 1046 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  33.85 
 
 		 1039 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  43.98 
 
 		 1045 aa  439  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  43.98 
 
 		 1049 aa  439  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  41.34 
 
 		 1044 aa  429  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4049  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.34 
 
 		 1079 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  41.81 
 
 		 1059 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  40.69 
 
 		 1043 aa  422  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  33.65 
 
 		 1048 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2183  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.43 
 
 		 1043 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505184  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3976  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.9 
 
 		 1079 aa  419  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  44.87 
 
 		 1067 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  42.47 
 
 		 1043 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  41.62 
 
 		 1051 aa  416  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  33.51 
 
 		 1048 aa  416  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  41.12 
 
 		 1074 aa  412  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3972  CzcA family heavy metal efflux protein  40.73 
 
 		 1057 aa  411  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3422  CzcA family heavy metal efflux protein  34.14 
 
 		 1048 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.380989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4112  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.54 
 
 		 1057 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1019  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.73 
 
 		 1054 aa  412  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.797494 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4833  CzcA family heavy metal efflux protein  40.74 
 
 		 1056 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  40.34 
 
 		 1058 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0656  cation efflux system protein cusA  34.45 
 
 		 1045 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.146377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  40.49 
 
 		 1065 aa  410  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  34.27 
 
 		 1047 aa  405  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.27 
 
 		 1047 aa  406  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3071  CzcA family heavy metal efflux protein  34.27 
 
 		 1047 aa  406  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  39.24 
 
 		 1066 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2563  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.96 
 
 		 1054 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725882 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0622  cation efflux system protein cusA  34.27 
 
 		 1047 aa  406  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00104736  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  40.76 
 
 		 1069 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4591  CzcA family heavy metal efflux protein  40.48 
 
 		 1055 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  40.41 
 
 		 1074 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0593  cation efflux system protein cusA  34.27 
 
 		 1047 aa  406  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0593  cation efflux system protein cusA  34.27 
 
 		 1047 aa  406  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550143  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00525  hypothetical protein  34.27 
 
 		 1047 aa  405  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.746936  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7981  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.81 
 
 		 1057 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  40.77 
 
 		 1058 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3426  cation efflux system protein cusA  41.65 
 
 		 1057 aa  402  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  41.99 
 
 		 1051 aa  403  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1109  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.73 
 
 		 1057 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36522  hitchhiker  0.00721325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  41.01 
 
 		 1052 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  41.44 
 
 		 1060 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3643  cation efflux system protein  41.44 
 
 		 1063 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1603  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.24 
 
 		 1052 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  27.03 
 
 		 1036 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0714  cation efflux system protein  40.61 
 
 		 1041 aa  398  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3813  CzcA family heavy metal efflux protein  39.74 
 
 		 1059 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  40.29 
 
 		 1052 aa  396  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  40.56 
 
 		 1056 aa  395  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  38.9 
 
 		 1059 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  40.56 
 
 		 1047 aa  396  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  40.4 
 
 		 1043 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  38.96 
 
 		 1042 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  41.03 
 
 		 1060 aa  395  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001395  cation efflux system protein cusA  40.69 
 
 		 1046 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0283098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  39.7 
 
 		 1047 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9869  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.16 
 
 		 1053 aa  390  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  39.37 
 
 		 1038 aa  389  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  39.45 
 
 		 1045 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  39.45 
 
 		 1045 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2458  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.64 
 
 		 1073 aa  390  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06366  hypothetical protein  40.33 
 
 		 1059 aa  389  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  40.04 
 
 		 1047 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  39.51 
 
 		 1045 aa  385  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  38.93 
 
 		 1045 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  39.81 
 
 		 1047 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0210  CzcA family heavy metal efflux protein  38.55 
 
 		 1045 aa  385  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00320  cation efflux system protein CusA  38.75 
 
 		 1045 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.665603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  39.48 
 
 		 1049 aa  386  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  34.98 
 
 		 1054 aa  385  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5686  CzcA family heavy metal efflux protein  38.99 
 
 		 1068 aa  386  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  40.26 
 
 		 1042 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  39.08 
 
 		 1045 aa  386  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  40.56 
 
 		 1042 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  38.93 
 
 		 1056 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  39.48 
 
 		 1049 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  38.88 
 
 		 1055 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5287  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.81 
 
 		 1055 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  40.15 
 
 		 1040 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  38.38 
 
 		 1049 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4103  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.56 
 
 		 1049 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  39.63 
 
 		 1048 aa  383  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6282  CzcA family heavy metal efflux protein  38.84 
 
 		 1068 aa  383  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491237  normal  0.311834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1646  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.81 
 
 		 1055 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>