More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0243 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0243  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
126 aa  256  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  38.66 
 
 
554 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
639 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 
702 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
664 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.91 
 
 
1242 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.51 
 
 
1218 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.79 
 
 
1233 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  38.39 
 
 
547 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
528 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
1279 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  40.74 
 
 
702 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
702 aa  63.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
764 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1406 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
528 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1222 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
776 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
530 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.28 
 
 
582 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
659 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1697  histidine kinase  38.26 
 
 
505 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
530 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.7 
 
 
1535 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
906 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
568 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  30.09 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3747  response regulator  29.17 
 
 
131 aa  58.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  33.33 
 
 
659 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  31.58 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
1261 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  47.69 
 
 
551 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3094  response regulator receiver protein  35.66 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6654  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
829 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000220106 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0418  response regulator receiver protein  33.04 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3195  response regulator receiver protein  35.66 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  34.78 
 
 
518 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
657 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
1223 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1287 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2627  response regulator receiver protein  31.15 
 
 
240 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  31.58 
 
 
120 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
776 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1328  response regulator receiver domain-containing protein  31.15 
 
 
240 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
917 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
539 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
778 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  30.7 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  31.58 
 
 
120 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6322  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.21 
 
 
458 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.385665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0829  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 
812 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0673  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.93 
 
 
474 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
845 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  34.21 
 
 
584 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.4 
 
 
1152 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
633 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0759  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
818 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
569 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6499  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.21 
 
 
458 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  34.55 
 
 
537 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6734  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.21 
 
 
458 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321079  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.86 
 
 
819 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
529 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
930 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 
224 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1088 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1736  response regulator receiver domain-containing protein  30.97 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000593066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.21 
 
 
463 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3910  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
850 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.302032  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2531  response regulator receiver protein  30.33 
 
 
240 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00970  two-component sensor molecule, putative  31.25 
 
 
1211 aa  54.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 
406 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
526 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.03 
 
 
226 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
866 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  35 
 
 
217 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
592 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3483  response regulator receiver protein  29.36 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000485228  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1914  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
815 aa  53.9  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.979442  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 
228 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
804 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6795  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
233 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
776 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  34.07 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.73 
 
 
225 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
938 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
1016 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 
761 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2044  response regulator receiver protein  30.63 
 
 
123 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0300859  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
657 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
641 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  32.74 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  31.01 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3921  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
808 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.799409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3808  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
808 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0284545  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1045  response regulator receiver protein  26.09 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.09 
 
 
1453 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
835 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  28.95 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4333  response regulator receiver protein  33.08 
 
 
706 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>