More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1091 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1091  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  100 
 
 		 451 aa  909    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.18691e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  44.84 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  43.69 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2089  signal recognition particle protein  44.73 
 
 		 443 aa  345  8e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00342036  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2656  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42 
 
 		 491 aa  340  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1418  signal recognition particle protein  41.4 
 
 		 504 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  41.15 
 
 		 508 aa  336  5e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.86 
 
 		 507 aa  334  1e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  41.45 
 
 		 512 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  41.36 
 
 		 485 aa  334  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  40.05 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  40.04 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4887  signal recognition particle protein  41.72 
 
 		 511 aa  332  7.000000000000001e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  40.52 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  40.55 
 
 		 463 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.05 
 
 		 447 aa  331  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0715  signal recognition particle protein  40.65 
 
 		 444 aa  329  7e-89  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  39.63 
 
 		 450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  41.96 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000306608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  41.69 
 
 		 458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  41.45 
 
 		 518 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1404  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40 
 
 		 491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.75 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  40.76 
 
 		 451 aa  326  5e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  41.08 
 
 		 518 aa  326  6e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  40.71 
 
 		 492 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  40.71 
 
 		 492 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.29 
 
 		 512 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  41.2 
 
 		 446 aa  325  9e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1624  signal recognition particle, subunit FFH/SRP54  41.74 
 
 		 467 aa  325  9e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.170579  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.58 
 
 		 492 aa  325  1e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14851  signal recognition particle protein (SRP54)  40.84 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  41.53 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.34 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  40.18 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  39.61 
 
 		 521 aa  323  3e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1517  Signal recognition particle protein  40.28 
 
 		 492 aa  323  4e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2714  signal recognition particle protein  42.46 
 
 		 505 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.236454  normal  0.0233143 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  39.11 
 
 		 494 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.78 
 
 		 449 aa  322  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1053  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.46 
 
 		 505 aa  322  7e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  40.92 
 
 		 453 aa  322  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  39.4 
 
 		 453 aa  322  9.000000000000001e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  39.37 
 
 		 452 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  40.18 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0353  signal recognition particle protein  41.31 
 
 		 504 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2779  Signal recognition particle protein  39.49 
 
 		 516 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1382  signal recognition particle protein  40.19 
 
 		 489 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  40.28 
 
 		 488 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3578  signal recognition particle protein  39.6 
 
 		 511 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.715062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.15 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1080  signal recognition particle protein  42.76 
 
 		 447 aa  320  1.9999999999999998e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.28377  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14711  signal recognition particle protein (SRP54)  39.95 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.657856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  40.92 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.44 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  39.86 
 
 		 469 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  40.19 
 
 		 448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  40.33 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  39.58 
 
 		 485 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  39.58 
 
 		 487 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.37 
 
 		 452 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  39.52 
 
 		 458 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  39.52 
 
 		 458 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  40.81 
 
 		 453 aa  319  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  39.33 
 
 		 451 aa  319  7e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  41.15 
 
 		 456 aa  319  7e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  40.83 
 
 		 515 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.600679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  40.46 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  38.75 
 
 		 449 aa  318  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  40 
 
 		 493 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  39.11 
 
 		 487 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2728  signal recognition particle protein  39.78 
 
 		 484 aa  317  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  38.04 
 
 		 479 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 458 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  39.95 
 
 		 458 aa  317  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14471  signal recognition particle protein (SRP54)  39.72 
 
 		 492 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  39.38 
 
 		 442 aa  316  4e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2894  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  42.69 
 
 		 521 aa  316  5e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.11 
 
 		 483 aa  316  7e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  38.41 
 
 		 447 aa  315  9e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  38.79 
 
 		 452 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  39.69 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  39.76 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  41.01 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  40.14 
 
 		 454 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  40.14 
 
 		 454 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  38.44 
 
 		 449 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  39.63 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  40.42 
 
 		 476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  39.21 
 
 		 449 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  40.27 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  41.33 
 
 		 452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  41.33 
 
 		 452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  39.42 
 
 		 485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.2 
 
 		 447 aa  313  4.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  39.44 
 
 		 449 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  38.34 
 
 		 446 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  40.65 
 
 		 453 aa  312  5.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  39.55 
 
 		 439 aa  312  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>