More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05890 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05890  sugar kinase, ribokinase  100 
 
 		 309 aa  597  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  42.43 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  45.9 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  45.85 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  45.25 
 
 		 308 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  43.52 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  47.68 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  44.55 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  44.88 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  41.45 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  38.69 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  47.3 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  44.3 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  42.36 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  47.14 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  36.88 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  40.66 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  44.44 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  42.38 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  42.38 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  42.38 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  42.38 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  42.38 
 
 		 314 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  42.38 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  47.96 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  36.54 
 
 		 310 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  40.88 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  42.05 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  45.14 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  43.62 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  46.62 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  42.05 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  43.43 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  40 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  47.64 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  42.05 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  44.78 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  38.46 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  45.64 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  47.3 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  47.3 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  39.46 
 
 		 301 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  44.11 
 
 		 302 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  44.19 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  39.8 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  39.61 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  41.08 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  41.44 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  41.84 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  40.07 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  41.33 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44.52 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  40.47 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  41 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  40.46 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  37.5 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  44.63 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  36.67 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  41.06 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  41.06 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  41.06 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  41.06 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  38.61 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  39.54 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  41.06 
 
 		 309 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  40.73 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  41.75 
 
 		 303 aa  185  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  40.26 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  41.33 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  45.18 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  39.81 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  44.86 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  42.42 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  34.87 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  36.36 
 
 		 340 aa  182  8.000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  36.21 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  36.21 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  41 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  48.26 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  36.21 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  39.6 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  36.21 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  41.33 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  41.5 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  36.21 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  37.71 
 
 		 398 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  40.26 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  39.86 
 
 		 403 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  46.46 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  39.93 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  39.47 
 
 		 308 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  39.47 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  39.47 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  40.13 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  41.06 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  34.55 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  34.55 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  40.97 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  40.26 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  40.26 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>