More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05840 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05840  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 405 aa  769    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.43766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  33.33 
 
 		 370 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  33.61 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0337  histidine kinase  31.62 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16990  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.566842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0572952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0184  regulatory protein LuxR  30.52 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  29.01 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  33.95 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  31.12 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  31.52 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  26.42 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000231241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1402  putative two-component system sensor kinase  31.42 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  33.97 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  29.58 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1602  histidine kinase  32.81 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0369038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8798  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.27 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0396  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  29.72 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.07 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  28.68 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  29.95 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  31.17 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  30.16 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  27.61 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.81 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  35.14 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  31.42 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2413  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  30.25 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1603  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  26.52 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.18 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.95 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  33.79 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  28.34 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  31.58 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  30.02 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21860  signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.194284  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02990  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  28.94 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  31.03 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 700 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  33.53 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2690  histidine kinase  28.95 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  0.172281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  31.1 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.43 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.92 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  27.9 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17160  signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.273662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.74 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3474  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.14 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0240  histidine kinase  31.21 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  29.59 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  29.51 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  30.05 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3356  histidine kinase  31.75 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10189  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06240  histidine kinase  30.4 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  27.82 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  27.84 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0367  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0318683  normal  0.223079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 775 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  32.71 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26890  signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.304615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.65 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0670  signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 869 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  25.23 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  30.53 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  33.19 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  27.12 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3677  histidine kinase  26.09 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  31.98 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1768  histidine kinase  32.11 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.686261  normal  0.0755696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  28.1 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>