91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0942 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0942  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349002  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2240  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  74.58 
 
 
408 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1476  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  50 
 
 
421 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.369147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1675  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  47.52 
 
 
424 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1152  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  48.15 
 
 
415 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0462586  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4575  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  43.23 
 
 
412 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2682  long-chain fatty acid transport protein  34.6 
 
 
345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0586571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1572  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  36.09 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5225  long-chain fatty acid transport protein  34.9 
 
 
393 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0007  putative outer membrane protein  39.04 
 
 
374 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.338152  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1637  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  39.04 
 
 
372 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1580  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.25 
 
 
407 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0010116  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2164  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  37.67 
 
 
382 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.407836  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1416  putative outer membrane protein  30.13 
 
 
404 aa  89  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.39768 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0590  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  39.31 
 
 
385 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.021151  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1579  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.55 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1377  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.17 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2346  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.54 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.222275  normal  0.578852 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1417  FadL family outer membrane protein  31.96 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1948  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.94 
 
 
519 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1590  porin  36.88 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0885726 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1947  long-chain fatty acid ABC transporter  26.04 
 
 
514 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3757  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.8 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0902024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0372  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.41 
 
 
448 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0475  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.31 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3046  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.83 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25 
 
 
449 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000690815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.53 
 
 
437 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  26.85 
 
 
437 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0389  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25 
 
 
449 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0390  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25 
 
 
449 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0415  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25 
 
 
449 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3584  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.02 
 
 
448 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.33 
 
 
424 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.96 
 
 
415 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1548  aromatic hydrocarbon degradation protein  25.35 
 
 
442 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000033121  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2620  long-chain fatty acid outer membrane transporter  21.49 
 
 
437 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0208452  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2531  long-chain fatty acid outer membrane transporter  21.49 
 
 
435 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876174  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  23.72 
 
 
429 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2745  long-chain fatty acid outer membrane transporter  21.49 
 
 
435 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00852795  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2634  long-chain fatty acid outer membrane transporter  21.49 
 
 
437 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0127967  hitchhiker  0.00000000000285546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2580  long-chain fatty acid outer membrane transporter  21.49 
 
 
435 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00696507  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.04 
 
 
450 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.33 
 
 
423 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  23.83 
 
 
421 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  23.71 
 
 
427 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.41 
 
 
421 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  23.64 
 
 
445 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3381  long-chain fatty acid outer membrane transporter  21.46 
 
 
440 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.81 
 
 
421 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3468  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.79 
 
 
451 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  21.78 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.34 
 
 
426 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  24.77 
 
 
438 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.98 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  23.33 
 
 
423 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0350  aromatic hydrocarbon degradation protein  25.46 
 
 
401 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000805243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  22.47 
 
 
424 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0339  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.44 
 
 
452 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000148311  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  23.61 
 
 
422 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.18 
 
 
364 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2724  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.22 
 
 
446 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6026  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.7 
 
 
431 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  28 
 
 
405 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1313  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  22.22 
 
 
446 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1309  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.22 
 
 
446 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.613202  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2640  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.22 
 
 
446 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2495  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.22 
 
 
446 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0560  long-chain fatty acid transport protein  23.56 
 
 
432 aa  49.7  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00871251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.99 
 
 
421 aa  49.7  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1506  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.99 
 
 
421 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0138985  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02229  hypothetical protein  22.22 
 
 
448 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02268  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.22 
 
 
448 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.99 
 
 
421 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3487  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.22 
 
 
446 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2503  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.22 
 
 
446 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5803  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.53 
 
 
432 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3092  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.19 
 
 
450 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148936 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  22.53 
 
 
432 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.87 
 
 
415 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.52 
 
 
417 aa  46.2  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  24.35 
 
 
419 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3793  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.44 
 
 
436 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0374  long-chain fatty acid transport protein  25.23 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.78 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3634  long-chain fatty acid transport protein  25.81 
 
 
428 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000535062  hitchhiker  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0328  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.83 
 
 
447 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  23.04 
 
 
482 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2884  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.64 
 
 
444 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  19.17 
 
 
424 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4546  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.36 
 
 
432 aa  42.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495383  normal  0.0136159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>