58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1572 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1572  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 		 383 aa  768    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2682  long-chain fatty acid transport protein  41.49 
 
 		 345 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0586571  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5225  long-chain fatty acid transport protein  38.75 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1152  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  35.42 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0462586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2240  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  35.75 
 
 		 408 aa  195  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1476  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  35.44 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.369147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1675  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.43 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4575  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  33.15 
 
 		 412 aa  189  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0942  hypothetical protein  36.09 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349002  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1590  porin  29.5 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0885726 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1377  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.08 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2346  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  36.77 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.222275  normal  0.578852 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2164  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.01 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.407836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0007  putative outer membrane protein  31.58 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.338152  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1637  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.58 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1580  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.54 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0010116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1948  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.32 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1417  FadL family outer membrane protein  31.69 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0590  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.12 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.021151  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1579  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.96 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1416  putative outer membrane protein  38.04 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.39768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1947  long-chain fatty acid ABC transporter  29.37 
 
 		 514 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  22.99 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  25.08 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  23.9 
 
 		 438 aa  53.5  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  25.32 
 
 		 429 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2824  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.64 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.71 
 
 		 417 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3381  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.97 
 
 		 440 aa  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0415  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.03 
 
 		 449 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.12 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0389  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.03 
 
 		 449 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0390  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.03 
 
 		 449 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  28.37 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000417169  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.89 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0475  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.03 
 
 		 451 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2745  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.45 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00852795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2580  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.45 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00696507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2634  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.45 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0127967  hitchhiker  0.00000000000285546 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2531  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.15 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3757  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0902024 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2620  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.45 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0208452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28 
 
 		 450 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.27 
 
 		 449 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000690815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.59 
 
 		 430 aa  46.6  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  31.82 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0372  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.82 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.91 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.03 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1506  long-chain fatty acid outer membrane transporter  31.82 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0138985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  31.06 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2503  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.7 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.26 
 
 		 421 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3584  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.07 
 
 		 448 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.5 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25 
 
 		 442 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.5 
 
 		 421 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>