223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2113 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 
364 aa  740    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  47.24 
 
 
450 aa  334  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  38.14 
 
 
450 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  39.69 
 
 
450 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3092  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  39.12 
 
 
450 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  38.13 
 
 
429 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  36.66 
 
 
405 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  36.74 
 
 
400 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  36.47 
 
 
424 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  35.01 
 
 
432 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  37.7 
 
 
442 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  34.04 
 
 
424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  34.35 
 
 
427 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  33.94 
 
 
423 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  33.13 
 
 
423 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.33 
 
 
415 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.53 
 
 
421 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  31.61 
 
 
421 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0035  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.99 
 
 
459 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05747  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.61 
 
 
421 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0306  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.75 
 
 
449 aa  194  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0350  aromatic hydrocarbon degradation protein  31.72 
 
 
401 aa  193  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000805243 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0068  aromatic hydrocarbon degradation protein  31.23 
 
 
417 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.952244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03551  outer membrane protein  31.4 
 
 
446 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.87 
 
 
426 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.07 
 
 
430 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0328  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.56 
 
 
447 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  29.16 
 
 
424 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0500  aromatic hydrocarbon degradation protein  29.97 
 
 
420 aa  178  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  28.53 
 
 
429 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1548  aromatic hydrocarbon degradation protein  30.09 
 
 
442 aa  175  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000033121  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3342  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  35.31 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15331  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1288  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.88 
 
 
565 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3824  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.23 
 
 
428 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  30.29 
 
 
422 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3839  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.21 
 
 
430 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2562  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.49 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000928224  hitchhiker  0.000000000130731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  28.73 
 
 
464 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000417169  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.68 
 
 
437 aa  166  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  31.27 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  31.09 
 
 
429 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  28.87 
 
 
438 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2824  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.27 
 
 
427 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  30.63 
 
 
442 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0475  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.9 
 
 
451 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  32.48 
 
 
445 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05817  hypothetical protein  30.35 
 
 
414 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.57 
 
 
449 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000690815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5070  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.17 
 
 
437 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0389  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.57 
 
 
449 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4546  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.5 
 
 
432 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495383  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  31 
 
 
419 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000183  long-chain fatty acid transport protein  30.43 
 
 
414 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0205909  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0372  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.95 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0390  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.92 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0415  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.92 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3757  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.66 
 
 
449 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0902024 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.51 
 
 
415 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3584  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.66 
 
 
448 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.68 
 
 
450 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0340  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.34 
 
 
450 aa  149  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.76 
 
 
424 aa  149  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.65 
 
 
419 aa  149  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.29 
 
 
421 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.29 
 
 
421 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1410  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.37 
 
 
406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.343268  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4378  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.21 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60730  putative outer membrane protein  27.55 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4491  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.21 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4009  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.92 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1506  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.29 
 
 
421 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0138985  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.37 
 
 
439 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.57 
 
 
416 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000123053  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.66 
 
 
417 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5803  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.04 
 
 
432 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3381  long-chain fatty acid outer membrane transporter  29.05 
 
 
440 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  28.74 
 
 
422 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3468  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.74 
 
 
451 aa  144  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0560  long-chain fatty acid transport protein  27.01 
 
 
432 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00871251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0891  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.39 
 
 
453 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00668397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.14 
 
 
420 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0339  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.23 
 
 
452 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000148311  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6026  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.04 
 
 
431 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.41 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.31 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1548  outer membrane protein P1  28.22 
 
 
453 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000809472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.74 
 
 
410 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  26.56 
 
 
482 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1773  hypothetical protein  30.4 
 
 
478 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2884  long-chain fatty acid outer membrane transporter  30.05 
 
 
444 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.1 
 
 
458 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3521  long-chain fatty acid transport protein, outer membrane protein  25.38 
 
 
407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0539  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.55 
 
 
488 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2687  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.65 
 
 
427 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000955558  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0374  long-chain fatty acid transport protein  29.85 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.96 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1252  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.11 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000958296  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1774  hypothetical protein  29.09 
 
 
480 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1414  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.83 
 
 
443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2503  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.92 
 
 
446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>