26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1416 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1416  putative outer membrane protein  100 
 
 		 404 aa  816    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.39768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1417  FadL family outer membrane protein  72.52 
 
 		 386 aa  591  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1580  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  71.22 
 
 		 407 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0010116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1579  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  58.15 
 
 		 460 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1948  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  68.82 
 
 		 519 aa  396  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1947  long-chain fatty acid ABC transporter  66.42 
 
 		 514 aa  384  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1590  porin  31.42 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0885726 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1377  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.34 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2164  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.61 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.407836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2346  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.17 
 
 		 394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.222275  normal  0.578852 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1637  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.18 
 
 		 372 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0007  putative outer membrane protein  30.18 
 
 		 374 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.338152  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0590  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.85 
 
 		 385 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.021151  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2240  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.02 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0942  hypothetical protein  30.13 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1152  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.75 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0462586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1476  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.58 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.369147 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5225  long-chain fatty acid transport protein  26.34 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2682  long-chain fatty acid transport protein  24.34 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0586571  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4575  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  24.42 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.77 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000579977  hitchhiker  0.00170597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1675  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.86 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1572  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  38.04 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.62 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.8 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.89 
 
 		 450 aa  46.6  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>