24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1948 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1948  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 		 519 aa  1051    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1947  long-chain fatty acid ABC transporter  53.56 
 
 		 514 aa  523  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1579  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  70.04 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1580  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  69.01 
 
 		 407 aa  411  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0010116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1416  putative outer membrane protein  68.82 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.39768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1417  FadL family outer membrane protein  66.78 
 
 		 386 aa  395  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2164  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  35.13 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.407836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1637  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.03 
 
 		 372 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0007  putative outer membrane protein  34.03 
 
 		 374 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.338152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1590  porin  35.27 
 
 		 377 aa  150  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0885726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2346  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.25 
 
 		 394 aa  126  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.222275  normal  0.578852 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0590  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.07 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.021151  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1377  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.36 
 
 		 379 aa  118  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2240  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.73 
 
 		 408 aa  90.9  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0942  hypothetical protein  27.94 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349002  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4575  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  25.1 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1572  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.32 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2682  long-chain fatty acid transport protein  27.57 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0586571  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5225  long-chain fatty acid transport protein  25.97 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1476  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.09 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.369147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1152  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.86 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0462586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1675  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.68 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.42 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000579977  hitchhiker  0.00170597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1252  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.62 
 
 		 446 aa  47  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000958296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>