27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1580 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1417  FadL family outer membrane protein  82.06 
 
 		 386 aa  660    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1580  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 		 407 aa  823    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0010116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1416  putative outer membrane protein  71.22 
 
 		 404 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.39768 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1579  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  62.34 
 
 		 460 aa  560  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1948  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  69.01 
 
 		 519 aa  411  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1947  long-chain fatty acid ABC transporter  64.64 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2164  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.89 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.407836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1377  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.34 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0590  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.58 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.021151  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1590  porin  29.41 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0885726 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1637  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.16 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0007  putative outer membrane protein  30.16 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.338152  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2346  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.11 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.222275  normal  0.578852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2240  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.57 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0942  hypothetical protein  29.25 
 
 		 296 aa  90.1  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1152  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.57 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0462586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1476  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.73 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.369147 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4575  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  25.5 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5225  long-chain fatty acid transport protein  25.36 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1675  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.87 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.43 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000579977  hitchhiker  0.00170597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2682  long-chain fatty acid transport protein  26.67 
 
 		 345 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0586571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1572  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.54 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  27.09 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.81 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.44 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0907  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.15 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000931505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>