64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2346 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2346  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 		 394 aa  779    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.222275  normal  0.578852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1590  porin  42.89 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0885726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0007  putative outer membrane protein  44.77 
 
 		 374 aa  272  9e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.338152  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1637  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  44.24 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2164  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  42.82 
 
 		 382 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.407836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1377  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  39.69 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0590  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  38.27 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.021151  normal  0.572596 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1416  putative outer membrane protein  31.44 
 
 		 404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.39768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1417  FadL family outer membrane protein  30 
 
 		 386 aa  180  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1579  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.39 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0371318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1580  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.67 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0010116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1948  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.14 
 
 		 519 aa  126  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1947  long-chain fatty acid ABC transporter  30.29 
 
 		 514 aa  121  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2240  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.2 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.53 
 
 		 428 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000579977  hitchhiker  0.00170597 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5225  long-chain fatty acid transport protein  28.75 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84588  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4575  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  26.21 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0942  hypothetical protein  34.36 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1152  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.29 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0462586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1572  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  36.77 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1476  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.26 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.369147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  23.94 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1675  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.59 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  23.45 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2682  long-chain fatty acid transport protein  28.22 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0586571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.88 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  23.01 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0560  long-chain fatty acid transport protein  25.81 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00871251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  25.82 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.12 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3634  long-chain fatty acid transport protein  29.76 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000535062  hitchhiker  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2436  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.73 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000365967  hitchhiker  0.00491561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  23.36 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  23.1 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.53 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.99 
 
 		 450 aa  53.9  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.18 
 
 		 421 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.9 
 
 		 421 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  22.06 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.55 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2269  outer membrane protein transport protein  23.39 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00153589  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  22.22 
 
 		 442 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.62 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3046  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.92 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.83 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  23.04 
 
 		 445 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2562  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.82 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000928224  hitchhiker  0.000000000130731 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002852  long-chain fatty acid transport protein  26.76 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.92 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.86 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  21.35 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3468  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.02 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.68 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0339  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.68 
 
 		 452 aa  46.6  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000148311  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4546  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.44 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495383  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001387  long-chain fatty acid transport protein  25 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.71 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.99 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2771  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.04 
 
 		 434 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000776056  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3824  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.43 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0561  long-chain fatty acid transport protein  26.23 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.22 
 
 		 364 aa  43.1  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>