207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1379 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 
450 aa  899    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  47.51 
 
 
364 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  38.63 
 
 
450 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  37.09 
 
 
429 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  36.62 
 
 
450 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3092  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.9 
 
 
450 aa  245  9e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.49 
 
 
442 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  33.99 
 
 
432 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  34.36 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.05 
 
 
424 aa  212  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.86 
 
 
400 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  30.11 
 
 
423 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03551  outer membrane protein  31.36 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  30.4 
 
 
424 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0350  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.41 
 
 
401 aa  201  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000805243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  29.91 
 
 
427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.63 
 
 
423 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0068  aromatic hydrocarbon degradation protein  31.41 
 
 
417 aa  192  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.952244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.77 
 
 
421 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.44 
 
 
421 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  29.67 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  29.65 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.3 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0306  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.18 
 
 
449 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126384 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0560  long-chain fatty acid transport protein  28.95 
 
 
432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00871251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  27.47 
 
 
429 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1548  aromatic hydrocarbon degradation protein  30.46 
 
 
442 aa  180  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000033121  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0328  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.35 
 
 
447 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  28.23 
 
 
429 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  27.72 
 
 
424 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0035  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.7 
 
 
459 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05747  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0475  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.21 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0372  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.71 
 
 
448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3584  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.71 
 
 
448 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.72 
 
 
437 aa  173  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  30 
 
 
464 aa  173  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000417169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.03 
 
 
450 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0415  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.28 
 
 
449 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0390  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.28 
 
 
449 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.28 
 
 
449 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000690815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  28.45 
 
 
445 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29 
 
 
426 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0389  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.28 
 
 
449 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  28.1 
 
 
422 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1288  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.66 
 
 
565 aa  170  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  27.65 
 
 
442 aa  170  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3757  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.73 
 
 
449 aa  169  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0902024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.32 
 
 
415 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0339  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.73 
 
 
452 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000148311  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0340  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.14 
 
 
450 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3824  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.17 
 
 
428 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  30.84 
 
 
419 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3468  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.62 
 
 
451 aa  162  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3839  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.95 
 
 
430 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60730  putative outer membrane protein  28.96 
 
 
463 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0500  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.05 
 
 
420 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4546  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.86 
 
 
432 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495383  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  28.69 
 
 
482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  27.56 
 
 
438 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3342  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.38 
 
 
436 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15331  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0539  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.12 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5070  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.84 
 
 
437 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.09 
 
 
417 aa  143  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.95 
 
 
410 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1414  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.72 
 
 
443 aa  143  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000739159  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1548  outer membrane protein P1  24.95 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000809472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.94 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000123053  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.14 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000183  long-chain fatty acid transport protein  28.4 
 
 
414 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0205909  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.08 
 
 
420 aa  139  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.94 
 
 
424 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3381  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.1 
 
 
440 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05817  hypothetical protein  28.15 
 
 
414 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.18 
 
 
415 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2562  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.46 
 
 
429 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000928224  hitchhiker  0.000000000130731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0891  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.6 
 
 
453 aa  136  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00668397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  28.32 
 
 
421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  28.32 
 
 
421 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2250  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.34 
 
 
407 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.12 
 
 
404 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2884  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.26 
 
 
444 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2824  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.51 
 
 
427 aa  133  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.62 
 
 
419 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1506  long-chain fatty acid outer membrane transporter  28.06 
 
 
421 aa  133  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0138985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3099  long-chain fatty acid transport protein, putative  27.1 
 
 
440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2687  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.28 
 
 
427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000955558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2178  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.04 
 
 
440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000636439  normal  0.0847993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.57 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3046  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.68 
 
 
430 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.12 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2620  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.16 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0208452  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2634  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.16 
 
 
437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0127967  hitchhiker  0.00000000000285546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  26.03 
 
 
409 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4491  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.68 
 
 
441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5803  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.06 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2470  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.42 
 
 
445 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000167182  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0374  long-chain fatty acid transport protein  27.71 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3487  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.05 
 
 
446 aa  127  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.97 
 
 
439 aa  127  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.16 
 
 
413 aa  127  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>