57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7466 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  191  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  43.59 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  43.59 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  41.03 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  47.44 
 
 		 79 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  40.51 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  38.96 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  38.75 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  38.96 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  37.18 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  42.31 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  37.33 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  35.53 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  39.74 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  34.62 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  41.56 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  34.62 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  38.96 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  40.26 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  40.79 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  35.53 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  34.62 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  35.9 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  35 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  36.51 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  32.99 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  32.99 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7098  type IV pilus assembly PilZ  37.66 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.867442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  34.38 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  35.71 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  39.34 
 
 		 417 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  36.84 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  35.06 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  28.42 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  35.9 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  36.84 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  39.71 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  40.74 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2832  hypothetical protein  32.47 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  26.92 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  35 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.31 
 
 		 657 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2833  type IV pilus assembly PilZ  35.48 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0990376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1913  hypothetical protein  29.11 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190295  hitchhiker  0.0055716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5621  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 96 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212596  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0481  hypothetical protein  34.62 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0546  hypothetical protein  34.62 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  30.65 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0297  hypothetical protein  28.3 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0551981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  39.29 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3537  hypothetical protein  28.3 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2803  hypothetical protein  33.87 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  33.85 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>