23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0087 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  207  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  82.35 
 
 		 106 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0047  hypothetical protein  89.29 
 
 		 106 aa  158  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.090381  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0384  type IV pilus assembly PilZ  79.17 
 
 		 108 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  82.22 
 
 		 104 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0080  hypothetical protein  77.55 
 
 		 102 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0205  hypothetical protein  79.35 
 
 		 104 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3800  hypothetical protein  61 
 
 		 104 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0398  hypothetical protein  58.59 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0528  hypothetical protein  57.84 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0493  type IV pilus assembly PilZ  56.31 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3854  hypothetical protein  57.58 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1875  hypothetical protein  63.95 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1495  hypothetical protein  56.57 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2410  type IV pilus assembly PilZ  62.07 
 
 		 91 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00616498  normal  0.0220666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3041  hypothetical protein  62.07 
 
 		 92 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  54.17 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  39.08 
 
 		 79 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  37.21 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1926  hypothetical protein  31.34 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  39.29 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  42.37 
 
 		 85 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.76 
 
 		 654 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  0.657901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>