29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0827 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  37.82 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  37.82 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  39.29 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  34.88 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  37.93 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  41.96 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  41.46 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  38.89 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  38.39 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  32 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  33 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  40.18 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  31.9 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  35.53 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  36.25 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  32.14 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  41.77 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  32.5 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3537  hypothetical protein  32.47 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0297  hypothetical protein  32.47 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0551981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  34.62 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0517  hypothetical protein  32.94 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511228  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  32.5 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>