44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2029 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  65.38 
 
 		 79 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  58.97 
 
 		 82 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  58.23 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  51.9 
 
 		 83 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  44.3 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  43.04 
 
 		 79 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  47.44 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  40.51 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  42.31 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  41.77 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  48.28 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  37.97 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  35 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  39.02 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  32.1 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  32.5 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  34.57 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  38.6 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  34.57 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  35.8 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  32.5 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  36.25 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  29.63 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.18 
 
 		 657 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7098  type IV pilus assembly PilZ  37.66 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.867442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5621  type IV pilus assembly PilZ  35.59 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212596  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  34.25 
 
 		 417 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  34.43 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2135  hypothetical protein  37.88 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  32.88 
 
 		 417 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  32.79 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2832  hypothetical protein  29.49 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  30.56 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  35.9 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>