48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5461 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  172  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  57.69 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  56.41 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  51.9 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  48.72 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  49.35 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  43.04 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  45.12 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  40.51 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  40.51 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  39.74 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  41.77 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  39.74 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  41.79 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  36.59 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  35.9 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  40.51 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  38.96 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  40.91 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  37.18 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  35.44 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  36.71 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7098  type IV pilus assembly PilZ  33.77 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.867442  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0229  hypothetical protein  35.44 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  32.5 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  35.44 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  32 
 
 		 417 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  35.06 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  32.91 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  34.62 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2831  hypothetical protein  30.86 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  34.62 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  34.62 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  43.75 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  31.65 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  35.94 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0833  type IV pilus assembly PilZ  27.63 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2495  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1913  hypothetical protein  29.49 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190295  hitchhiker  0.0055716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  34.52 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2135  hypothetical protein  28.99 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  32.14 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>