28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4028 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  65.38 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  65.38 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2798  type IV pilus assembly PilZ  61.18 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2795  hypothetical protein  60.26 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  37.33 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  32.05 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  38.81 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  36.59 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  45.61 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  36.59 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  34.15 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1926  hypothetical protein  36.76 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  32.47 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  39.06 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  42.11 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  33.77 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  31.25 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  33.75 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  35.94 
 
 		 83 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  36.36 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  31.25 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  38.18 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  30.65 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  34.57 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1032  hypothetical protein  38.46 
 
 		 111 aa  40  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1126  hypothetical protein  38.46 
 
 		 111 aa  40  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>