19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1926 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1926  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  181  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2259  hypothetical protein  80.23 
 
 		 104 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  38.57 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  37.14 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2798  type IV pilus assembly PilZ  37.35 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  34.88 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2795  hypothetical protein  30.56 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  37.31 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  31.08 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  32.08 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  31.34 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0968  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.810794  normal  0.576496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1121  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3041  hypothetical protein  34.67 
 
 		 92 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  30.3 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0384  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0297  hypothetical protein  22.78 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0551981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3537  hypothetical protein  22.78 
 
 		 120 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3242  type IV pilus assembly PilZ  37.74 
 
 		 82 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>