11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2259 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2259  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1926  hypothetical protein  80.23 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  32.53 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  33.73 
 
 		 85 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2798  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2795  hypothetical protein  30.12 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  32.14 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  33.93 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 82 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  36.11 
 
 		 103 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0057  type IV pilus assembly PilZ  42.37 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>