16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2795 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2795  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2798  type IV pilus assembly PilZ  68.24 
 
 		 85 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  67.47 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  66.27 
 
 		 85 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  60.26 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  32.89 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  32.5 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1926  hypothetical protein  30.88 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  32.91 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  38.24 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2259  hypothetical protein  30.3 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  40.74 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  40.45 
 
 		 151 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  25.32 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  32.47 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  38.6 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>