28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1467 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  204  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  44.58 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  48.81 
 
 		 83 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  41.77 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  42.31 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  36.59 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  37.66 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  36.84 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  36.36 
 
 		 79 aa  57  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  35.53 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  37.8 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  32.05 
 
 		 85 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  32.5 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  34.48 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  29.49 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1913  hypothetical protein  34.88 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190295  hitchhiker  0.0055716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  35 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  28.75 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2798  type IV pilus assembly PilZ  31.17 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2135  hypothetical protein  36.21 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2803  hypothetical protein  34.62 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1849  hypothetical protein  27.62 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00097738  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  34.55 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2519  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0949328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2795  hypothetical protein  25.32 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2832  hypothetical protein  28.95 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>