16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2832 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2832  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  29.21 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  29.49 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  34.83 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  34.48 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  34.48 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  32.47 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  34.88 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  29.76 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  28.09 
 
 		 114 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  29.49 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  35.23 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  28.95 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  28.95 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7098  type IV pilus assembly PilZ  32.1 
 
 		 82 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.867442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>