27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3181 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 81 aa  163  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7098  type IV pilus assembly PilZ  45 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.867442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  33.77 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  34.57 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  32.5 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  30.77 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  32.91 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  36.25 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  32.5 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  31.25 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  35 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  34.15 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  38.33 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  28.05 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  29.63 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  26.92 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  29.63 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  31.51 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2831  hypothetical protein  37.97 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  36.51 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4196  hypothetical protein  30.86 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0356494  normal  0.382226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  29.87 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2832  hypothetical protein  28.95 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>