28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5895 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 81 aa  158  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  76.54 
 
 		 88 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  31.65 
 
 		 82 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  35.06 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  35.38 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1913  hypothetical protein  38.03 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190295  hitchhiker  0.0055716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  35.38 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  39.29 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  32.79 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  33.77 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  30.38 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  32.79 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1032  hypothetical protein  32.14 
 
 		 111 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1126  hypothetical protein  32.14 
 
 		 111 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  36.07 
 
 		 83 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  30.3 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  34.43 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  30.3 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2795  hypothetical protein  32.47 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2798  type IV pilus assembly PilZ  37.35 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  32.69 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4710  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0924938 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  33.96 
 
 		 114 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>