49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1244 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 82 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  48.1 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  48.1 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  43.59 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  48.1 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  45.57 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  43.59 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  40.51 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  40.51 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  37.97 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  41.25 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  40.74 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  36.59 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.29 
 
 		 657 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  34.94 
 
 		 114 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  31.71 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  31.71 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  32.53 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  30.49 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  35.9 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  36.59 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  35 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0229  hypothetical protein  36.84 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  36.25 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  39.29 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  39.24 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  34.18 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  37.04 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5687  hypothetical protein  34.15 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2832  hypothetical protein  36.71 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  39.29 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  35.9 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  36.84 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  36.84 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1913  hypothetical protein  31.58 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190295  hitchhiker  0.0055716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5621  type IV pilus assembly PilZ  32.53 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212596  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7098  type IV pilus assembly PilZ  35.44 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.867442  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0833  type IV pilus assembly PilZ  32.89 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2495  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2831  hypothetical protein  30.77 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  32.5 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  34.62 
 
 		 118 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  41.77 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 417 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2135  hypothetical protein  32.31 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0057  type IV pilus assembly PilZ  43.86 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  34.25 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4180  type IV pilus assembly PilZ  37.93 
 
 		 111 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>