29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0689 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  89.36 
 
 		 101 aa  167  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  62.03 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  40.79 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  32.99 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  41.89 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  35.9 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  41.89 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2831  hypothetical protein  38.16 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0481  hypothetical protein  35.71 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0546  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  43.86 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0517  hypothetical protein  43.4 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511228  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  40 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  34.62 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1032  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1126  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  40.74 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  40.26 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  35.53 
 
 		 88 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  32.05 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3537  hypothetical protein  28.57 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  39.29 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  41.82 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  38.67 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  37.66 
 
 		 79 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>