32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3553 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 119 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  65.55 
 
 		 119 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  67.23 
 
 		 119 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  50.85 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  36.52 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  35.65 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  40.51 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  44.58 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  36.47 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  35.44 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  28.1 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  36.25 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  39.29 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  32.1 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  35.44 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  37.18 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  34.57 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  30.12 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  35 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  32.05 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  32.05 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  34.55 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0833  type IV pilus assembly PilZ  27.63 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2495  normal  0.757001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>