55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3752 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 136 aa  274  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  63.71 
 
 		 131 aa  157  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  60.98 
 
 		 133 aa  153  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  58.14 
 
 		 148 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  58.14 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  57.48 
 
 		 137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  47.5 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  40.74 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  38.75 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  36.47 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  41.77 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  30.95 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  32.54 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  38.55 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  32.14 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  35 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  39.02 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  43.24 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  41.89 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  29.47 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2831  hypothetical protein  41.18 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  35.8 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  38.89 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  41.89 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  41.89 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  35.8 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  38.55 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  42.35 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  32.5 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  33.85 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0517  hypothetical protein  36.36 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511228  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  34.15 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  32.47 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1126  hypothetical protein  32.84 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  37.93 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  34.18 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1032  hypothetical protein  32.84 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  34.57 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1913  hypothetical protein  36.36 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190295  hitchhiker  0.0055716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0229  hypothetical protein  33.77 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  31.25 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  32.29 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  35.59 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0481  hypothetical protein  33.77 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5621  type IV pilus assembly PilZ  35.48 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212596  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2798  type IV pilus assembly PilZ  33.77 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0546  hypothetical protein  33.77 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  36.21 
 
 		 657 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0297  hypothetical protein  26.98 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0551981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  33.77 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>