18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0517 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0517  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  296  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511228  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0481  hypothetical protein  71.33 
 
 		 150 aa  197  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0546  hypothetical protein  71.33 
 
 		 185 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0297  hypothetical protein  47.27 
 
 		 120 aa  105  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0551981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3537  hypothetical protein  47.27 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2435  hypothetical protein  37.84 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.185892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  38.27 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  38.27 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  35.63 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  39.19 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  41.51 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  36.49 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2831  hypothetical protein  34.44 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  43.4 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  43.4 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  36.36 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  33.78 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  32.94 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>