52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2803 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 131 aa  264  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  73.68 
 
 		 133 aa  191  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  63.71 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  57.38 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  57.38 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  57.38 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  49.4 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  41.46 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  37.33 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  34.71 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  32.73 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  28.1 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  37.86 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  38.55 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  39.51 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  33.88 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  39.51 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  36.25 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  38.46 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  37.04 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2831  hypothetical protein  43.48 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  40.79 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  42.67 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  40.79 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  33.75 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  30.16 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  34.15 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  41.56 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  32.93 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  35.8 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.33 
 
 		 657 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0229  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  42.5 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  36.62 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  35.38 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  35.56 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  35 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  33.85 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  39.06 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5621  type IV pilus assembly PilZ  36.92 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212596  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  31.82 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0481  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0517  hypothetical protein  33.78 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511228  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0546  hypothetical protein  35.14 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0297  hypothetical protein  23.46 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0551981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  30.86 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1435  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.41 
 
 		 896 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.665756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1913  hypothetical protein  34.62 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190295  hitchhiker  0.0055716 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3537  hypothetical protein  26.92 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7098  type IV pilus assembly PilZ  32.05 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.867442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>