19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0481 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0546  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  304  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0481  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  303  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0517  hypothetical protein  71.33 
 
 		 144 aa  197  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511228  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3537  hypothetical protein  45.22 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0297  hypothetical protein  44.35 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0551981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2435  hypothetical protein  40.51 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.185892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  32.08 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  35.8 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2831  hypothetical protein  42.62 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  36.49 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  36.59 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  41.51 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  37.84 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  35.71 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  35.71 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  35.14 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  33.77 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.97 
 
 		 228 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  34.62 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>