50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4321 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  98.65 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  84.96 
 
 		 137 aa  222  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  55.88 
 
 		 136 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  55.47 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  59.5 
 
 		 133 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  52.56 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  43.59 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  35.4 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  40.51 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  37.36 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  37.96 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  37.78 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  37.18 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  36.45 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  38.27 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  31.62 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  30.16 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  28.95 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  36.25 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  34.83 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  36.25 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  30.86 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6500  type IV pilus assembly PilZ  32.11 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.504949  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0678  type IV pilus assembly PilZ  39.73 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0689  type IV pilus assembly PilZ  39.73 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.130937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  40.96 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0517  hypothetical protein  38.27 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511228  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2831  hypothetical protein  38.46 
 
 		 92 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  45 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0546  hypothetical protein  35.8 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0481  hypothetical protein  35.8 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  36.59 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7098  type IV pilus assembly PilZ  33.73 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.867442  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  32.5 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  30.49 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  34.62 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  32.5 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2832  hypothetical protein  34.48 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  28.42 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  29.63 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  32.31 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  30 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0229  hypothetical protein  29.87 
 
 		 83 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5621  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212596  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4180  type IV pilus assembly PilZ  32.95 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  30.3 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3537  hypothetical protein  27.69 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>