27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1603 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  242  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  44.58 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  38.79 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  36.52 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  40.28 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  36.45 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  41.56 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  38.55 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  36.45 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  33.04 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  33.88 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  39.74 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  41.43 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  40.24 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  35.9 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  27.19 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  35.23 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  31.82 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  40.96 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  42.86 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2832  hypothetical protein  34.83 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  37.14 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  42.59 
 
 		 84 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  35.9 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  30.1 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  34.62 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>