34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4529 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 99 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  49.41 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  36.96 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  36.96 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  34.15 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  37.35 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  35.9 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  43.59 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  37.68 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  36.71 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  36.25 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  37.18 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  36.05 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  37.18 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  36.25 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  32.22 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  37.18 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  35 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  32.93 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  35 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5621  type IV pilus assembly PilZ  37.18 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212596  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  30.86 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  38.57 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  39.51 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  45.45 
 
 		 122 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  37.29 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  27.71 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>