52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1523 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  65.38 
 
 		 79 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  63.29 
 
 		 82 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  60.26 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  50.63 
 
 		 79 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  50.63 
 
 		 79 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  51.9 
 
 		 84 aa  84.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  49.35 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  50.75 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  42.31 
 
 		 83 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  42.11 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  40.26 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  36.84 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  37.04 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  40.54 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  30 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  35 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  37.84 
 
 		 417 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2410  type IV pilus assembly PilZ  35.8 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.847624  normal  0.205618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  34.18 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  26.25 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  32.05 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4746  type IV pilus assembly PilZ  35 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.03 
 
 		 657 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  31.25 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  32.5 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  32.91 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  36.84 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  32.5 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  33.75 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  37.18 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  33.75 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2135  hypothetical protein  33.85 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  32.79 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  31.25 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1926  hypothetical protein  32.08 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5621  type IV pilus assembly PilZ  33.9 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212596  normal  0.144053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4006  type IV pilus assembly PilZ  34.67 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0788285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5687  hypothetical protein  35 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2259  hypothetical protein  33.93 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7098  type IV pilus assembly PilZ  30.38 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.867442  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.15 
 
 		 654 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3242  type IV pilus assembly PilZ  32.14 
 
 		 82 aa  40.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.439074  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  40.26 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0827  type IV pilus assembly PilZ  35.19 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  32.43 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2833  type IV pilus assembly PilZ  30.23 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0990376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  35.62 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  37.74 
 
 		 103 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1913  hypothetical protein  31.58 
 
 		 99 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190295  hitchhiker  0.0055716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>