22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2941 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  86.9 
 
 		 85 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2798  type IV pilus assembly PilZ  78.57 
 
 		 85 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2795  hypothetical protein  67.47 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  65.38 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1926  hypothetical protein  36.76 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  36.25 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2259  hypothetical protein  34.85 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  34.18 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  28.75 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0493  type IV pilus assembly PilZ  43.1 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0398  hypothetical protein  40.68 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5895  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  36.36 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  32.43 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0205  hypothetical protein  40.68 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  32.14 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  40.68 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1032  hypothetical protein  31.82 
 
 		 111 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  32.47 
 
 		 137 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1126  hypothetical protein  31.82 
 
 		 111 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>