20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0205 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0205  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  213  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  86.54 
 
 		 104 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0080  hypothetical protein  84.69 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  75 
 
 		 106 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0384  type IV pilus assembly PilZ  79.38 
 
 		 108 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  79.55 
 
 		 101 aa  144  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0047  hypothetical protein  72.12 
 
 		 106 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.090381  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0398  hypothetical protein  58.16 
 
 		 105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0528  hypothetical protein  53.85 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1495  hypothetical protein  59.38 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0493  type IV pilus assembly PilZ  57.58 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3854  hypothetical protein  54.37 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1875  hypothetical protein  56.73 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2410  type IV pilus assembly PilZ  59.77 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00616498  normal  0.0220666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3041  hypothetical protein  58.62 
 
 		 92 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3800  hypothetical protein  59.38 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  53.12 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  47.46 
 
 		 654 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  42.37 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  40.68 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>