17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1875 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1875  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  209  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3800  hypothetical protein  80.77 
 
 		 104 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1495  hypothetical protein  79.81 
 
 		 106 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3854  hypothetical protein  79.38 
 
 		 106 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0528  hypothetical protein  69.57 
 
 		 107 aa  140  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  59.62 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0047  hypothetical protein  66.67 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.090381  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0493  type IV pilus assembly PilZ  57.45 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0398  hypothetical protein  63.41 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  68.35 
 
 		 101 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0384  type IV pilus assembly PilZ  56.12 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  59.6 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0205  hypothetical protein  56.73 
 
 		 104 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0080  hypothetical protein  52.48 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3041  hypothetical protein  59.26 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2410  type IV pilus assembly PilZ  58.02 
 
 		 91 aa  93.2  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00616498  normal  0.0220666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  46.15 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>