23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2527 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  86.9 
 
 		 85 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2798  type IV pilus assembly PilZ  76.19 
 
 		 85 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2795  hypothetical protein  66.27 
 
 		 85 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4028  hypothetical protein  65.38 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1926  hypothetical protein  38.81 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  32.5 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2411  type IV pilus assembly PilZ  38.75 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  35.29 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  35.44 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  42.37 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0205  hypothetical protein  42.37 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  34.52 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  33.77 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  44.07 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  34.18 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  35.62 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  42.37 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  35.44 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  33.77 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  33.77 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0080  hypothetical protein  42.37 
 
 		 102 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>