22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4775 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0398  hypothetical protein  56.32 
 
 		 105 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0493  type IV pilus assembly PilZ  51.49 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  53.47 
 
 		 104 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0384  type IV pilus assembly PilZ  53.85 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0205  hypothetical protein  53.12 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0080  hypothetical protein  52.17 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  53.66 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0047  hypothetical protein  53.66 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.090381  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  55.56 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3854  hypothetical protein  43.56 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0528  hypothetical protein  43.4 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1495  hypothetical protein  44 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1875  hypothetical protein  46.15 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102054  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3041  hypothetical protein  47.67 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3800  hypothetical protein  45.26 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2410  type IV pilus assembly PilZ  47.67 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00616498  normal  0.0220666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1926  hypothetical protein  37.31 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.440558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2527  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2259  hypothetical protein  36.11 
 
 		 104 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2941  hypothetical protein  36.36 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2798  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>