18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3041 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3041  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2410  type IV pilus assembly PilZ  84.62 
 
 		 91 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00616498  normal  0.0220666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0055  hypothetical protein  63.95 
 
 		 106 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0384  type IV pilus assembly PilZ  60.67 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0047  hypothetical protein  64.71 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.090381  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0087  hypothetical protein  62.07 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423806  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0080  hypothetical protein  57.78 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.270368  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0205  hypothetical protein  58.62 
 
 		 104 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.229186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0626  hypothetical protein  61.18 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0227611  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0398  hypothetical protein  60.47 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3854  hypothetical protein  55.91 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3800  hypothetical protein  62.96 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1495  hypothetical protein  57.95 
 
 		 106 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1875  hypothetical protein  59.26 
 
 		 104 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0528  hypothetical protein  53.93 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0493  type IV pilus assembly PilZ  56.63 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4775  type IV pilus assembly PilZ  47.67 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0542658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1926  hypothetical protein  32.39 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.440558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>